Im Zuge des bundesweiten Förderprogramms steigt BeBa Energie 1999 als eines der ersten schleswig-holsteinischen Elektrounternehmen in die professionelle Errichtung von Solaranlagen auf Gebäudedächern ein. Das 100.000-Dächer-Programm ist eine Weiterentwicklung des 1.000-Dächer-Programms aus den frühen 1990er Jahren. Beim 100.000-Dächer-Programm werden im Rahmen des Erneuerbare-Energien-Gesetzes Photovoltaikanlagen von Privatpersonen, Freiberuflern und mittelständischen Unternehmen gefördert. Bis zum Erreichen des Förderungsvolumens 2003 entstehen in Deutschland über 300 Megawatt installierte Leistung.